Carl de Keyzer a commencé sa carrière de photographe indépendant en 1982, tout en assurant sa subsistance en tant que professeur de photographie à l'Académie royale des Beaux-Arts de Gand, en Belgique. Parallèlement, son intérêt pour le travail d'autres photographes l'a amené à cofonder et à codiriger la galerie XYZ-Photography. Nommé par Magnum en 1990, il est devenu membre à part entière en 1994.
De Keyzer construit des projets de livres et d'expositions par le biais d'une approche accumulative, en utilisant des formats moyens et grands. Parmi les exemples, citons "Homo Sovieticus 1989" sur l'effondrement de l'Union soviétique, "ZONA 2003" (visite de 50 camps de prisonniers en Sibérie), "Trinity 2007" (un livre conceptuel sur la trinité du pouvoir), "DPR Korea" (2017). Son projet phare, "God, Inc. I et II" a capturé la vie religieuse en marge de la société américaine en 1992 et 2020.
Les systèmes de pouvoir et leur impact visuel sur la société sont les principaux thèmes de son travail. Les sujets liés au colonialisme, au communisme, à la religion... sont documentés dans leur propre style propagandiste. L'esthétique et les "styles maison" des systèmes en question sont souvent adoptés pour obtenir un effet de superposition.